WOH247 kênh việc làm online chuyên nghiệp, an toàn và nhanh chóng
angle-down angle-left angle-right angle-up bill-momo Asset 1 Asset 1 chat close Asset 1 creditcard dollar-circle dollar-phone dot-matrix endow entertainment facebook-circle entertainment Asset 1 gift-momo gift handshake hotline invoice license Asset 1 Asset 1 Asset 1 Asset 1 svg-note phone-circle Asset 1 Asset 1 Asset 1 search setting shopping-bag Asset 1 Asset 1 Asset 1 truck Asset 1

Mô phỏng virus SARS-CoV-2 trên siêu máy tính Frontera

Mô phỏng mới có thể giúp các nhà nghiên cứu phát triển các loại thuốc và vắc xin chống lại đại dịch Covid-19.

Mô phỏng toàn nguyên tử virus cúm (trái) và virus gây dịch Covid-19 /// Ảnh: Lorenzo Casalino (UCSD), TACC

Mô phỏng toàn nguyên tử virus cúm (trái) và virus gây dịch Covid-19

Các nhà khoa học đang chuẩn bị một mô hình máy tính khổng lồ của virus SARS-CoV-2, với mong đợi sẽ cung cấp cái nhìn sâu sắc về cách chủng virus mới lây nhiễm trong cơ thể người. Họ đã thực hiện những bước đầu tiên, thử nghiệm các phần đầu tiên của mô hình và tối ưu hóa bộ mã trên siêu máy tính Frontera trong Trung tâm Điện toán Nâng cao Texas (TACC) tại Đại học Texas ở Austin (Mỹ). Kiến thức thu được từ mô hình đầy đủ có thể sẽ giúp các nhà nghiên cứu trên thế giới phát triển thuốc và vắc xin mới chống lại virus, theo Science Daily.
Rommie Amaro, Giáo sư hóa học và hóa sinh tại Đại học California, San Diego (UCSD) ở Mỹ là người dẫn đầu nỗ lực xây dựng mô hình nguyên tử hoàn chỉnh đầu tiên cho vỏ bọc của virus gây dịch Covid-19. “Nếu chúng ta có một mô hình tốt về hình dáng vỏ bọc bên ngoài của virus nhìn như thế nào và cách nó hoạt động ra sao, chúng ta sẽ có cái nhìn sâu hơn về các thành phần khác nhau có liên quan đến nhận dạng phân tử”, Giáo sư Amaro nói.
Nhận dạng phân tử liên quan đến cách thức virus tương tác với thụ thể angiotensin chuyển đổi enzyme 2 (ACE2) và có thể nhắm đến các mục tiêu khác bên trong màng tế bào chủ. ACE2 là một enzyme gắn vào mặt ngoài của các tế bào trong phổi, động mạch, tim, thận và ruột.
Giáo sư Amaro dự đoán mô hình virus SARS-CoV-2 chứa khoảng 200 triệu nguyên tử, một con số đáng ngại vì sự tương tác của mỗi nguyên tử với nhau đều phải được tính toán. Nhóm của Giáo sư Amaro có quy trình tiếp cận theo mô hình lai (hybrid) hoặc tích hợp. “Chúng tôi đang cố gắng kết hợp dữ liệu ở các độ phân giải khác nhau thành một mô hình gắn kết có thể được mô phỏng trên các cơ sở cao cấp như siêu máy tính Frontera. Về cơ bản, chúng tôi bắt đầu với các thành phần riêng lẻ, trong đó các cấu trúc đã được phân giải ở độ phân giải nguyên tử hoặc gần nguyên tử. Chúng tôi cẩn thận đưa từng bộ phận này lên máy tính, chạy và tiến vào trạng thái ổn định. Sau đó, chúng tôi chúng tôi có thể đưa chúng vào mô phỏng lớp vỏ lớn hơn với các phân tử lân cận”, Giáo sư Amaro cho biết.
Trong hai ngày 12 và 13.3, phòng thí nghiệm của Giáo sư Amaro đã chạy mô phỏng động lực phân tử trên 4.000 giao điểm, hoặc khoảng 250.000 lõi xử lý trên Frontera, siêu máy tính trong danh sách 5 siêu máy tính hàng đầu thế giới và là siêu máy tính xếp hạng nhất về học thuật thep bảng xếp hạng tháng 11.2019 của tổ chức Top500. Ngoài ra, Frontera còn là hệ thống siêu máy tính hiệu năng cao cấp được Quỹ Khoa học Quốc gia (NSF) của chính phủ Mỹ hỗ trợ.
“Mô phỏng kích thước ở cấp độ khổng lồ chỉ có thể chạy trên một siêu máy tính như Frontera hoặc trên máy ở Bộ Năng lượng Mỹ. Chúng tôi đã liên lạc ngay với nhóm quản lý Frontera và họ đã rất tích cực hỗ trợ, cố gắng tối ưu hóa mã để các mô phỏng này có thể chạy hiệu quả nhất có thể”, Giáo sư Amaro cho hay.
Dự án hiện tại của Giáo sư Amaro đối với virus gây dịch Covid-19 dựa trên thành công của cô với mô phỏng toàn bộ nguyên tử vỏ bọc của virus gây bệnh cúm được công bố trên tạp chí khoa học ACS Central Science hồi tháng 2.2020. Giáo sư Amaro nói rằng dự án về virus gây cúm có một số điểm tương đồng đáng chú ý với những gì nhóm nghiên cứu của cô đang theo đuổi đối với virus SARS-CoV-2.
Nhận Xét Bằng Chứng Nhận Tiền Của Các Bạn Làm Việc Với woh247
Nhận Xét Bằng Chứng Nhận Tiền Của Các Bạn Làm Việc Với woh247
Giới Thiệu Công Việc Và Hướng Dẫn Đăng Ký Làm Việc Với woh247.com
Giới Thiệu Công Việc Và Hướng Dẫn Đăng Ký Làm Việc Với woh247.com
Hướng dẫn làm dự án PROL
Hướng dẫn làm dự án PROL
Hướng dẫn làm dự án TYPER
Hướng dẫn làm dự án TYPER
Hướng dẫn làm dự án HaicaptchaAUTO
Hướng dẫn làm dự án HaicaptchaAUTO
Hướng dẫn làm dự án Haicaptcha
Hướng dẫn làm dự án Haicaptcha
5 mẹo nhỏ có thể giúp bạn tăng lương nhanh chóng
5 mẹo nhỏ có thể giúp bạn tăng lương nhanh chóng
 Từ 0 giờ 1/4/2020 thực hiện cách ly toàn xã hội trên phạm vi toàn quốc
Từ 0 giờ 1/4/2020 thực hiện cách ly toàn xã hội trên phạm vi toàn quốc
Hàng nghìn bệnh viện, khách sạn, khu cách ly được miễn phí điện 100% trong 3 tháng
Hàng nghìn bệnh viện, khách sạn, khu cách ly được miễn phí điện 100% trong ...
Chật vật mưu sinh bằng nhiều cách thức trong giai đoạn "ngồi yên tại chỗ chống Covid-19"
Chật vật mưu sinh bằng nhiều cách thức trong giai đoạn "ngồi yên tại chỗ ch...
Bị phạt 200.000 đồng vì không đeo khẩu trang ra đường
Bị phạt 200.000 đồng vì không đeo khẩu trang ra đường
Giới siêu giàu châu Á  mua đảo tư nhân tự cách ly chống dịch Covid
Giới siêu giàu châu Á mua đảo tư nhân tự cách ly chống dịch Covid
7 điều trong cuộc sống khiến bạn phải hối tiếc nhất khi về già
7 điều trong cuộc sống khiến bạn phải hối tiếc nhất khi về già
10 quy tắc tiền bạc bạn nên thuộc nằm lòng để có cuộc sống thoải mái hơn
10 quy tắc tiền bạc bạn nên thuộc nằm lòng để có cuộc sống thoải mái hơn
Hãy dành 2 phút để đọc 5 câu nói có thể sẽ thay đổi được vận mệnh của bạn
Hãy dành 2 phút để đọc 5 câu nói có thể sẽ thay đổi được vận mệnh của bạn
Cập nhật số ca tử vong trên thế giới vì Covid-19 đã lên đến 24.000 người
Cập nhật số ca tử vong trên thế giới vì Covid-19 đã lên đến 24.000 người
WO24H kênh việc làm online chuyên nghiệp, an toàn và nhanh chóng